©Birgit Lang
Bodenmetagenomik
Ricarda Lehmitz & Miklós Bálint
ZUSAMMENFASSUNG
Böden erfüllen eine Vielzahl von Ökosystemleistungen, die für das menschliche Wohlergehen essentiell sind, wie die Nahrungsmittelproduktion und die Wasserfilterung. Sie sind Lebensraum für eine ungeheure Vielfalt von Tieren und Mikroorganismen, deren biologische Aktivität die grundlegende Basis der meisten Bodenfunktionen ist. Trotz ihrer Bedeutung fehlen Methoden zur Erfassung der Bodenfauna und ihrer Funktionen. Unser Projekt zielt daher darauf ab, ein Monitoringverfahren zu entwickeln, das auf Metagenomik basiert. Für die Referenzbibliothek wollen wir ~300 Bodentierarten aus einem breiten taxonomischen Spektrum sequenzieren, wobei alle in Deutschland häufigen und verbreiteten Gruppen von Bodenwirbellosen berücksichtigt werden.
TBG GENOMIC STATS:
| De novo genomes | 0 |
| Re- sequenced genomes | 0 |
| Shallow sequenced genomes | 354 |
| Total genomes | 0 |
| Total data: | 0.2 Tera bases |
SPECIES INVOLVED:
| SPECIES: | Date (due) | NCBI | Coverage Quality (planned) |
| Soil animals: | |||
| 53 species of Nematoda | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 40 species of Oligochaeta | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 10 species of Microturbellaria | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 50 species of Oribatida | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 60 species of Gamasina | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 5 species of Actinedida | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 1 species of Endeostigmata | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 40 species of Collembola | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 30 species of Diplopoda | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| 10 species of Chilopoda | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |
| Soil fungi: | |||
| 55 species of fungi | 01.07.2022 | Yes | 0.5 |