@florianschulz.org

Strategien zur Optimierung der Genflussanalyse in der Artbildung am Beispiel von Giraffen, Bären, Walen und Seehunden 

Axel Janke

Zusammenfassung
In diesem Projekt werden wir die Genome mehrerer Säugetiere sequenzieren, um zu untersuchen wie sich Arten auf der Sequenz-Ebene unterscheiden. Besonders Methoden wie D-stat, Phylonet, D-foil, CoalHMM werden zeigen, wie vergangener und aktueller Genfluss oder sein Fehlen die Artbildung beeinflussen.
Zu Beginn werden wir uns auf bereits laufende Projekte mit Giraffen, Bären und Seehunden konzentrieren. Für diese taxonomischen Gruppen ist der Genfluss dokumentiert bzw. er wird angenommen. Die neuen Erkenntnisse werden auch mit Hilfe von alternativen Darstellungen von evolutiven Prozessen, wie z.B. Netzwerken anstelle von bifurkalen Bäumen, untersucht.
Bislang wurden Studien der Vergleichenden Genomik nur mit einigen wenigen Individuen vorgenommen. Der erwartete Anstieg von hunderten von Genomen von mehreren verwandten Arten, werden es jedoch erforderlich machen effiziente Prozeduren zu entwickeln, um auch diese große Anzahl von Genomen in derartige Studien einzubeziehen.
Während der Laufzeit von TBG werden wir weitere taxonomische Gruppen einbeziehen, insbesondere Invertebraten, deren Genome für Studien der Vergleichenden Genomik zugänglich gemacht werden.

TBG GENOMIC STATS:

SPECIES INVOLVED: